聊聊KRAS(一)

有朋友对Revolution Medicine感兴趣,这是个做RAS的公司,既然如此,就把之前写过的关于KRAS的文章润色润色搬过来吧。

KRAS是个很有名的oncogene,各种变异的KRAS在癌症中广泛存在。但40多年来KRAS一直被认为是undruggable,原因主要有二:第一是没有binding pocket,第二是这玩意儿跟GTP/GDP bind太紧了,生理体系中到处都是GTP/GDP,所以你很难找到一个小分子能够compete GTP/GDP。UCSF的大牛Kevan Shokat研究KRAS快一辈子,2013年的时候他发表了一篇Nature(https://www.nature.com/articles/nature12796),找到了一个covalent small molecule可以bind且inhibit KRAS G12C(KRAS中的一种特定变异)。实际上是巧妙的利用了cysteine的亲核性,找到了一个covalent inhibitor(induced small molecule binding pocket)。但该文中的小分子一点都不drug like。


Mirati很早就开始和Shokat合作,意图找到更drug like的covalent inhibitor,这个项目最终成就了Adagrasib。所以,虽然Amgen的sotorasib首先获得了紧急批准,但实际上Adagrasib才是真正的first in class。而Amgen的sotorasib其实是个非常优雅的patent bust,它的研发靠的就是大公司猛砸化学资源,这个项目是Amgen当时的head of med chem 从Pfizer加入Amgen后做的第一个大项目,一下就放了50个做药化的人,所有合成的分子不管potent与否全都喂大老鼠,豪到很多时候还不知道potency就已经知道F%了。当然这是Pfizer的惯用手法,Pfizer当时做COVID药paxlovid基本也是这么搞的。

然而,sotorasib并没能获得FDA的最终正式批准,FDA写了几百页的feedback,原因相当复杂,主要的大概有以下几点?1. 虽然Progression-Free Survival数据略微有效(最多5周)但overall survival数据显示该药无效。说人话就是,抗癌效果还是不太明显。2. 有很多效果可能更好的竞品。3. Trial有technical问题。虽然这并没有导致制药界质疑KRAS有关的pathway,但确实导致了Mirati贱卖给了BMS,因为Adagrasib其实并没有比sotorasib好太多,Mirati的leadership错过了卖Mirati的最好时间,但同时BMS也是个冤大头,毕竟market普遍并不看好Adagrasib的销售。

本章结束前来回顾一下KRAS pathway,如下图所示KRAS属于比较上游的oncogene,有KRAS ON (binding GTP) 和KRAS OFF (binding GDP)两种状态。当KRAS处于KRAS ON状态的时候,下游的pathway会打开,促进细胞分裂和生长。而在癌细胞中,KRAS的变异会导致GTP无法水解,KRAS一直处于ON的状态,细胞持续繁殖导致癌变。



目前KRAS在临床研究中的小分子药物绝大部分靶向的是KRAS OFF状态,这其中包括Amgen的sotorasib和Mirati的adagrasib。而下期要讲的Revolution Medicine的几个RAS相关的pipeline则是molecular glue,靶向的是KRAS ON状态。靶向KRAS ON与靶向KRAS OFF比有一个明显优势:癌变的KRAS大都处于ON的状态,所以target KRAS ON可以说更disease relevant。

评论

  1. shokat做的工作都挺神奇的,他们组这几年我最喜欢的工作是22年的血脑屏障mTOR。另外之前哪个做出KRAS共价药的一作前一阵还报道了一个可以被直接泛素化的小分子代替protac,也蛮有意思的

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